辣椒经粉碎到所需大小后，由皮带运输机将辣椒碎块送至储料斗，再由螺旋提料器将辣椒碎块均匀连续的送入主机磨室内，由于两辊的转速不同产生相对运动形成挤压和剥刮力使辣椒磨制成粉。辣椒碎块研磨后的混合粉被风机所产生的吸力形成的风吸走、进入提粉器，然后辣椒混合粉进行分选工序，细度过粗的辣椒颗粒通过螺旋提料器重新进入主机磨室内，合格细粉则随气流进入成品集粉器，经出粉管排出，即为成品。

在主机磨室内因被磨辣椒碎块中有一定的水分，研磨时生热，水气蒸发，以及整机各管道接口不严密，外界气体被吸入，使循环气压增高，保证辣椒磨粉机在负压状态下工作，所增加的气流量通过余风管排入除尘器，被净化后排入大气。